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Servicios

La siguiente es la lista de servicios instalados en el clúster del CNCA (aplicaciones como servicio). Algunos de ellos fueron desarrolladas en el laboratorio (como el segundo, “Transformada de Trazo mejorada”), otros son implementaciones locales o adaptaciones de aplicaciones de código abierto a necesidades específicas de proyectos de investigación propios o de grupos de investigación de las universidades estatales:

 

Servicio

WRF (Weather Research Forecast)

Fuente

http://www.wrf-model.org/index.php

Usuario

Proyecto de colaboración CATIE-CNCA

Propósito

Modelado climático

Estado

En uso

Notas

Al momento de la elaboración de este informe se coordina con los socios del CATIE la implementación del servicio en el clúster del CATIE, con el fin de poder realizar pruebas simultáneas y complementarias de los modelos desarrollados con WRF.

 

Servicio

Transformada de Trazo mejorada

Fuente

CNCA

Usuario

CNCA (pruebas de uso), PRIAS/CeNAT (clasificación de imágenes)

Propósito

Análisis de texturas en imágenes aéreas para su clasificación

Estado

Prototipo funcional

Notas

Se planea escalar el prototipo a un servicio operativo para el PRIAS/CeNAT. Adicionalmente, la investigación de uno de los candidatos a becas CeNAT 2014, el estudiante Ricardo Román, se centrará en un mejoramiento del método para aumentar su eficiencia computacional.

 

Servicio

Mathematica

Fuente

http://www.wolfram.com

Usuario

General

Propósito

Modelado matemático y computacional

Estado

En uso

Notas

Ninguna.

 

Servicio

GridMathematica

Fuente

http://www.wolfram.com/gridmathematica/

Usuario

General

Propósito

Modelado matemático y computacional distribuido

Estado

Aún no en uso

Notas

A pesar de que el servicio está instalado en el clúster del CNCA, no está en uso porque no ha sido configurado en forma óptima. Para esto, estamos a la espera de que la empresa proveedora, Wolfram Research, le de al personal del CNCA un taller de configuración. Este taller se planea para su entrega entre los meses de mayo y junio de 2014.

 

Servicio

Quantum Expresso

Fuente

http://www.quantum-espresso.org

Usuario

Escuela de Física UCR (Profesor Dr. Federico Muñoz y otros investigadores)

Propósito

Modelado y simulación en Física Cuántica

Estado

En uso

Notas

Durante los primeros meses del 2014 se planea mejorar el servicio con un componente de administración de tareas, para poder extenderlo a más usuarios en el clúster.

 

Servicio

Antismash

Fuente

http://www.secondarymetabolites.org

Usuario

Centro de Investigaciones en Estructuras Microscópicas, CIEMIC/UCR

Propósito

Modelado en bioinformática

Estado

En uso

Notas

Investigadores del CIEMIC utilizan este servicio para intentar mejorar los resultados publicados en un póster en la CLCAR 2013.

 

Servicio

Mothur

Fuente

http://www.mothur.org

Usuario

Centro de Investigaciones en Estructuras Microscópicas, CIEMIC/UCR

Propósito

Modelado en bioinformática

Estado

En uso

Notas

Investigadores del CIEMIC utilizan este servicio para intentar mejorar los resultados publicados en un póster en la CLCAR 2013.

 

Servicio

Phylip

Fuente

http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html

Usuario

Centro de Investigaciones en Estructuras Microscópicas, CIEMIC/UCR

Propósito

Creación de árboles filogenéticos

Estado

En uso

Notas

Ninguna.

 

Servicio

ROMS

Fuente

https://www.myroms.org

Usuario

Departamento de Oceanografía, UNA

Propósito

Simulación oceanográfica

Estado

Aún no en uso

Notas

En el segundo semestre de 2014 se planea una capacitación para el personal del Departamento de Oceanografía, con el fin de que se comience a hacer uso del servicio.

 

Servicio

Radianza

Fuente

http://radsite.lbl.gov/radiance/

Usuario

Laboratorio de Investigaciones en Innovación Tecnológica, LIIT/UNED

Propósito

Rectificación de imágenes aéreas

Estado

En uso

Notas

Ninguna.

 

Servicio

Octave

Fuente

http://www.gnu.org/software/octave/

Usuario

General

Propósito

Modelado y simulación matemática

Estado

En uso

Notas

El CNCA negocia actualmente con la comunidad de Servicios de Computación Avanzada para América Latina y el Caribe (SCALAC), la instalación de este y otros servicios similares en la malla computacional latinoamericana.

 

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